Tento server pro střední a velké organizace umožňuje provoz podnikové infrastruktury použití komerčních aplikací a elektronické transakce. Windows Server 2003 R2 nabízí všechny výhody Serveru 2003 s SP1 a navíc významně zlepšuje správu identit a přístupových práv, správů serverů na pobočkách firem, správu a konfiguraci úložišť dat a podporu pro běh aplikací uvnitř i vně firmy. Je snadno integrovatelný do existujícího prostředí s Windows 2003 servery, neboť sdílí stejnou podporu aplikacím, ovladatelnost a spravovatelnost jako existující serversy s Windows Serverem 2003 s SP1. COEM verze, k prodeji pouze s novým PC